Κατά την ψύξη του δέρματος προκαλείται ο σχηματισμός παγοκρυστάλλων εντός και εκτός των κυττάρων. Αποτέλεσμα αυτού είναι η στάση του αίματος εντός των αγγείων, η ιστική ανοξία και τελικά η νέκρωση του παθολογικού ιστού.

Ως επιτυχημένη τεχνική κρυοχειρουργικής θεωρείται η ταχεία ψύξη της βλάβης και η βραδεία απόψυξη αυτής. Ας σημειωθεί ότι πολλαπλές μικρής διάρκειας συνεδρίες κρυοθεραπείας προκαλούν μεγαλύτερη ιστική βλάβη από μια και μεγάλης διάρκειας συνεδρία.